Departamento de Morfología y Biología Celular


Atlas
Interactivo de Histología

INDICE

Presentación del proyecto
Arquitectura
Entornos de utilización  
Demostración guiada
y documentación

Area de descarga
Cómo contribuir
Solicitud de imágenes
Autores y colaboradores



    Demostracion guiada y documentacion  


Indice:

  1. Descripción general
  2. Configuración
  3. Consultas
  4. Resultados de la búsqueda
  5. Estudio de la imagen
  6. Actualización del Atlas

Descripción general

El área de trabajo principal está compuesto por tres pestañas, siendo solamente una de ellas visible en cada momento: Búsquedas, Resultados e Imagen y estudio. El paso de una a otra es automático siguiendo un orden lógico. También es posible situarse cualquiera de ellas pulsando sobre su nombre.

La barra de menú permite configurar la aplicación, aprovechar sus características y consultar esta ayuda.

La barra de herramientas muestra un extenso campo de texto que se, según la pestaña donde estemos trabajando, nos indica de la progresión de la consulta o, en la pestaña 'Imagen y estudio', el elemento de la imagen señalado por la flecha del ratón. A su lado hay dos botones que nos permiten reducir y ampliar la imagen. Para más detalles, consulte la sección Estudio y preparación.

Configuración

Configuración del cliente de red 

Ajuste el parámetro tipo del archivo histo.cfg a remote (tipo=remote).

Para poder consultar la base de datos -imprescindible- han de estar correctamente configuradas la dirección del servidor donde ésta se aloja, el puerto asociado, el usuario de consulta de la base de datos y su password. Seleccionando ...Valores por defecto en la ventana de configuración del servidor, la aplicación se conectará al Atlas Interactivo de Histología mantenido por el Departamento de Morfología y Biología Celular de la Universidad de Oviedo. Si no fuera así, es posible que el servidor esté temporalmente fuera de servicio. Pruebe pasado un tiempo y si el problema persiste, no dude ponerse en contacto con los responsables, en la siguiente dirección.

Cómo realizar la configuración del servidor: Archivo ... Configuración del servidor ... IP : dirección-ip (p.e. 127.0.0.1) ó nombre-dns (p.e. localhost) ... Puerto : núm_puerto (p.e. 5432)...

Configuración del cliente local

Ajuste el parámetro tipo del archivo histo.cfg a local (tipo=local).

Directorio de las imágenes: selecccionar el directorio donde se encuentra la colección de imágenes y pulse Seleccionar directorio cuando éste se resalte..

Consultas

Las consultas se realizan en la pestaña Búsquedas.

Búsqueda temática

La modalidad de búsqueda temática permite consultar las imágenes por aparatos: Búsqueda temática ... Seleccione aparato.

Búsqueda compleja

Es posible realizar búsquedas según múltiples campos ( Organo, Tipo celular, Tejido o Indice, que engloba microestructuras, palabras clave y otros elementos de interés, como estratos, etc... ) con tantos términos de búsqueda como se desee: Formulario de consulta múltiple ... Seleccione operador, es decir, Y para buscar aquellas imágenes que contengan todos los términos introducidos; O para buscar las imágenes que contengan alguno de los términos introducidos.

Cada término de consulta va separado por un espacio en blanco, por ejemplo, núcleo nucleólo.

Cuando un término de búsqueda esté constituído por varias palabras, se delimitará por ':', por ejemplo, :papila dérmica:.

Los términos de búsqueda se pueden escribir directamente en los campos de texto correspondientes; o bien seleccionarlos a partir de la lista que se genera a la izquierda del formulario al pulsar el botón correspondiente al nombre del campo ( Organo, Tipo celular, etc ... ).

Resultados de la búsqueda

Los resultados de la búsqueda se muestran en la pestaña Resultados, presentándose en una tabla.

Los datos que describren cada imagen son: título, microscopía, técnica/tinción, objetivo con el que se realizó la fotografía y una vista previa a pequeño tamaño. Las columnas pueden redimensionarse pulsando sobre sus limites y arrastrando e intercambiar su posición haciendo pulsando sobre su nombre y arrastrando.

Estudio de la imagen

El estudio se muestra en la pestaña Imagen y estudio.Consta de dos partes -redimensionables- separadas por un marco que se puede desplazar pulsando y arrastrando con el ratón.

Datos de la imagen

En la parte izquierda de la pantalla, un árbol muestra de manera esquemática los datos de interés. Siempre: título, microscopía, técnica y tejido. Dependiendo de la imagen: tipos celulares, microestructuras e índice ( otros datos de interés como, por ejemplo, estratos ... ).

Si pulsamos sobre el nombre de un tipo celular, microestructura o índice y éste es claramente visible en la imagen (como ocurrirá la mayor parte de las veces), será inmediatamente mostrado y adecuadamente señalado en la imagen de la derecha.

Para eliminar la señalización, hemos de pulsar sobre el elemento resaltado ( en el lado derecho, sobre la imagen ) con el botón derecho del ratón.

Imagen

La imagen se muestra por defecto en el lado derecho de la pantalla. Podemos verla a pantalla completa pulsando y arrastrando la barra que separa ambas zonas o bien pulsando doblemente sobre la flecha que indica hacia la izquierda, situada en la parte superior de la misma.

Inicialmente, se muestra a bajo aumento. Podemos ver la imagen a mayor aumento pulsando sobre el botón con el símbolo + situado a la derecha en la barra de herramientas.Es posible conseguir un aumento todavía mayor repitiendo la operación. Para reducirla, pulsar el botón con el símbolo - situado al lado del anterior.

Al desplazar el puntero del ratón sobre los elementos destacados en el estudio del lado izquierdo, éste cambiará de forma ( pasando de flecha a mano ). Si pulsamos - en esa posición - con el botón izquierdo del ratón, comprobaremos cómo se llama, pues aparecerá reflejado en el campo de texto de la barra de herramientas.

 

 

Actualización del Atlas

Configuración de actualización

Archivo... Configuración de actualización

Cliente local

Herramientas... Actualizar. De acuerdo a los datos que haya configurado anteriormente, comprobará si hay nuevas preparaciones y, en caso afirmativo, actualizará la base de datos y descargará las nuevas imágenes, previa confirmación.

CLiente de red

El proceso es el mismo que para la versión Ms-Access, excepto un paso adicional necesario. Para actualizar la nueva base de datos, habrá que restaurarla manualmente. En el directorio pghisto será descargado un archivo pghisto.sql. Es un volcado de la nueva base de datos. El administrador actualizará la base de datos, por ejemplo, con el comando: psql -e histologia < pghisto.sql.